有兩種基本幾何形狀的UASB反應器：即矩形和圓形。這兩種類型的反應器都已大量應用于實際中。

圓形反應器具有結構較穩定的點，同時對于圓形反應器在同樣的面積下，其周長比正方形的少12。所以圓形池子的建造費用比具有相同面積的矩形反應器少要12。但是圓形反應器的這一點僅僅在采用單個池子時才成立，所以，單個或小的反應器可以建造成圓形的。
而大的反應器經常建成矩形的或方形的。當建立兩個或兩個以上反應器時，矩形反應器可以采用共用壁。當建造多個矩形反應器時有其性。對于采用公共壁的矩形反應器，池型的長寬比對造價也有較大的影響。對于UASB反應器建造多個池子的系統是有益的，這可以增加處理系統的適應能力。如果有多個反應池的系統，則可能關閉一個進行維護和修理，而其他單元的反應器繼續運行。
混凝土結構的UASB反應器是為常見的結構和材料型式，但是采用化和系列化的考慮結構的通用性和簡單性，在此基礎上形成的系列化才能有生命力和的。

厭氧反應器三相分離器三相分離器是厭氧反應器的核心裝置，主要應用于UASB、EGSB、IC等厭氧反應器中，它在厭氧反應中可實現固、液、氣三相分離。因三相分離的效果直接決定了厭氧工藝的成敗，所以三相分離器的設計參數要嚴謹，性能良好的三相分離器是UASB、EGSB、IC反應器高負荷、穩定良好運行的保證。

厭氧反應器三相分離器隨著污水與污泥相接觸而發生厭氧反應，產生沼氣（氣體是甲烷和二氧化碳）引起污泥床擾動。在污泥床產生的氣體中有一部分附著在污泥顆粒上，自由氣泡和附著在污泥顆粒上的氣泡上升至反應器的頂部。污泥顆粒上升撞擊到脫氣擋板的底部，這引起附著的氣泡釋放；脫氣的污泥顆粒沉淀回到污泥床的表面。自由氣體和從污泥顆粒釋放的氣體被收集在反應器頂部的集氣室內。液體中包含一些剩余的固體和生物顆粒進入到沉淀室內，剩余固體和生物顆粒從液體中分離并通過反射板落回到污泥層的上面。分離氣體、固體后的液體繼續上升，從出水堰溢流，經集水槽排出。沼氣聚集于三相分離器頂部，通過氣管排出。高濃度有機生產廢水經過厭氧反應器預處理后，有機物得到大量去除，COD大幅度下降。